Bio Informatician 36u/w
Volgnummer: 110642
Publicatiedatum: 18-12-2025
Locatie: BILTHOVEN
Standplaats: BILTHOVEN
Duur: 20-01-2026 - 30-09-2026
Optie tot verlenging: Ja
Reageren voor: 02-01-2026
Project:
In 2026 lopen een aantal projecten ter vervanging van bestaande dataverwerkingstools en in de verbetering van ons standaard surveillance data platform. in dit jaar is de bedoeling dat in korte tijd een aantal onderdelen worden gerealiseerd zodat daarna geleidelijk verder aan de implementatie kan worden gewerkt. het grotere doel is het verder standaardiseren van datastromen die binnen de publieke gezondheidszorg door het RIVM worden gebouwd, zowel voor de eigen taken als om informatie te delen met de partners in de publieke gezondheidszorg. De data engineer met name werken binnen het team dat in 2026 deze veranderingen gaat realiseren. Onderdeel is kennisoverdracht, zodat aan het eind van de opdrachttijd alle relevante kennis is overgedragen.
•
• Het ontwerpen en implementeren van bioinformatica-oplossingen voor pathogeenanalyse (virussen, bacteriën, etc.).
• Het onderhouden, uitbreiden en standaardiseren van gespecialiseerde bioinformatica-pipelines (geschreven in Python & Snakemake)
• Ontwikkelen van geautomatiseerde rapportage data workflows ter behoeve van klinische respons op basis van analyseresultaten.
• Kwaliteitsborging en accreditatie van oplossingen die moeten voldoen aan standaarden en principes zoals ISO15189, FAIR data, en open- science.
• Het schrijven van uitgebreide documentatie toegankelijk voor zowel technici als non-technici ten behoeve van kennisoverdracht.
• Het afstemmen van workflow-, tooling-, of rapportage-vereisten met inhoudelijk experts en geautomatiseerde processen hierop afstemmen.
Functie-eisen:
Algemeen:
Het ontwerpen en implementeren van bioinformatica-oplossingen voor pathogeenanalyse (virussen, bacteriën, etc.).
Het onderhouden, uitbreiden en standaardiseren van gespecialiseerde bioinformatica-pipelines (geschreven in Python & Snakemake)
Ontwikkelen van geautomatiseerde rapportage data workflows ter behoeve van klinische respons op basis van analyseresultaten.
Specifiek:
Kwaliteitsborging en accreditatie van oplossingen die moeten voldoen aan standaarden en principes zoals ISO15189, FAIR data, en open-science.
Het schrijven van uitgebreide documentatie toegankelijk voor zowel technici als non-technici ten behoeve van kennisoverdracht.
Het afstemmen van workflow-, tooling-, of rapportage-vereisten met inhoudelijk experts en geautomatiseerde processen hierop afstemmen.
Vereisten Profiel:
Afgeronde HBO+ opleiding in bioinformatica, moleculaire biologie, (medische) microbiologie of computationele biologie.
Aantoonbare en gedocumenteerde vaardigheid in Python
Kennis van microbiologie, moleculaire biologie en pathogeenanalyse.
Professionele beheersing van het Engels én minimaal niveau B1 Nederlands.
Overige kennisvereisten:
Aantoonbare kennis en/of ervaring in bioinformatica met betrekking tot de analyse van Bacteriën, Virussen, Schimmels OF Parasieten.
Aantoonbare ervaring met bioinformatica-specifieke workflow management systemen zoals Snakemake
Ervaring met Git versiebeheer en package management (Conda/Mamba/Pypi, Apptainer/Singularity) is essentieel
Wensen:
Aanvullende kennis:
Aantoonbare ervaring in code-documentatie ten behoeve van efficiente kennisoverdracht
Ervaring met SQL en data modelling
Ervaring met machine learning methodologieën en statistische analyse. Solliciteer nu!
Duur: 20-01-2026 - 30-09-2026
Optie tot verlenging: Ja
Reageren voor: 02-01-2026
Project:
In 2026 lopen een aantal projecten ter vervanging van bestaande dataverwerkingstools en in de verbetering van ons standaard surveillance data platform. in dit jaar is de bedoeling dat in korte tijd een aantal onderdelen worden gerealiseerd zodat daarna geleidelijk verder aan de implementatie kan worden gewerkt. het grotere doel is het verder standaardiseren van datastromen die binnen de publieke gezondheidszorg door het RIVM worden gebouwd, zowel voor de eigen taken als om informatie te delen met de partners in de publieke gezondheidszorg. De data engineer met name werken binnen het team dat in 2026 deze veranderingen gaat realiseren. Onderdeel is kennisoverdracht, zodat aan het eind van de opdrachttijd alle relevante kennis is overgedragen.
•
• Het ontwerpen en implementeren van bioinformatica-oplossingen voor pathogeenanalyse (virussen, bacteriën, etc.).
• Het onderhouden, uitbreiden en standaardiseren van gespecialiseerde bioinformatica-pipelines (geschreven in Python & Snakemake)
• Ontwikkelen van geautomatiseerde rapportage data workflows ter behoeve van klinische respons op basis van analyseresultaten.
• Kwaliteitsborging en accreditatie van oplossingen die moeten voldoen aan standaarden en principes zoals ISO15189, FAIR data, en open- science.
• Het schrijven van uitgebreide documentatie toegankelijk voor zowel technici als non-technici ten behoeve van kennisoverdracht.
• Het afstemmen van workflow-, tooling-, of rapportage-vereisten met inhoudelijk experts en geautomatiseerde processen hierop afstemmen.
Functie-eisen:
Algemeen:
Het ontwerpen en implementeren van bioinformatica-oplossingen voor pathogeenanalyse (virussen, bacteriën, etc.).
Het onderhouden, uitbreiden en standaardiseren van gespecialiseerde bioinformatica-pipelines (geschreven in Python & Snakemake)
Ontwikkelen van geautomatiseerde rapportage data workflows ter behoeve van klinische respons op basis van analyseresultaten.
Specifiek:
Kwaliteitsborging en accreditatie van oplossingen die moeten voldoen aan standaarden en principes zoals ISO15189, FAIR data, en open-science.
Het schrijven van uitgebreide documentatie toegankelijk voor zowel technici als non-technici ten behoeve van kennisoverdracht.
Het afstemmen van workflow-, tooling-, of rapportage-vereisten met inhoudelijk experts en geautomatiseerde processen hierop afstemmen.
Vereisten Profiel:
Afgeronde HBO+ opleiding in bioinformatica, moleculaire biologie, (medische) microbiologie of computationele biologie.
Aantoonbare en gedocumenteerde vaardigheid in Python
Kennis van microbiologie, moleculaire biologie en pathogeenanalyse.
Professionele beheersing van het Engels én minimaal niveau B1 Nederlands.
Overige kennisvereisten:
Aantoonbare kennis en/of ervaring in bioinformatica met betrekking tot de analyse van Bacteriën, Virussen, Schimmels OF Parasieten.
Aantoonbare ervaring met bioinformatica-specifieke workflow management systemen zoals Snakemake
Ervaring met Git versiebeheer en package management (Conda/Mamba/Pypi, Apptainer/Singularity) is essentieel
Wensen:
Aanvullende kennis:
Aantoonbare ervaring in code-documentatie ten behoeve van efficiente kennisoverdracht
Ervaring met SQL en data modelling
Ervaring met machine learning methodologieën en statistische analyse. Solliciteer nu!